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次世代シーケンシングサービス 

第2世代、第3世代のシーケンシングおよび光学ゲノムマッピングプラットフォームを用いたハイスループットシーケンシングにより、高品質で解釈可能な結果を提供します。


RNA シーケンシング (RNA-Seq)

 

RNA-Seqプラットフォームは、細胞株、急速凍結組織、全末梢血、FFPEブロックおよび切片、末梢血単核球 (PBMC)、トータルRNA、および生検組織を含む様々なサンプルで測定可能です。ライブラリー調製キットとして、mRNA用のIllumina以外のキット、mRNA用のIllumina Truseq、mRNA、lncRNA、および microRNA 用のリボソーム RNA-seqがご利用可能です。

応用例:

  • 差異的遺伝子発現
  • 機能アノテーション、経路およびネットワーク分析
  • ドライバー変異の予測
  • 腫瘍純度解析
  • 分子サブタイピング解析
  • リクエストに応じた硬化されたヒト腫瘍データとの比較分析
  • その他、解析に対応するオプションあり

RNA-Seq

 

全エクソームシーケンス(WES)

 

細胞株、急速凍結組織、全末梢血、FFPEブロックおよび切片、PBMC、生検組織、口腔スワブを用いて WES 解析をご利用いただけます。

応用例:

  • 遺伝子変異やコピー数変異などの、DNAレベルでのゲノムバリアントを同定
  • 共発現ネットワーク解析
  • リクエストに応じて公開されたヒト腫瘍データとの比較分析
  • その他、解析に対応するオプションあり

WES

 

全ゲノムシーケンシング(WGS)/全ゲノムバイサルファイトシーケンシング(WGBS)

 

細胞株、急速凍結組織、全末梢血、FFPEブロックおよび切片、PBMC、生検組織、口腔スワブなど、複数のサンプルでWGS/WGBS サービスをご利用いただけます。

WGS応用例:

  • 遺伝子変異の同定
  • コピー数多型の検出
  • 大きな構造変化 (SV) の検出

WGS

WGBS応用:

  • エピゲノミクス
  • 遺伝子メチル化解析

WGBS

 

単一細胞シーケンシング(10xゲノム)

 

細胞株、新鮮組織、全末梢血およびPBMCを用いて、シングルセルRNA-SeqおよびT細胞受容体(TCR)シーケンシングアッセイをご利用いただけます。

応用例:

  • 不均一な細胞集団の性質決定および同定
  • 新しい細胞マーカーおよび調節経路を発見する
  • 新しい細胞タイプ、細胞状態および希少細胞タイプを発見
  • 発生におけるヒエラルキーを再構築し、関係性を明らかにする
  • 健康な組織と病気の組織および臓器のプロファイリング

シングルセルシーケンシングサービスでは以下のようなバイオインフォマティクス解析も提供しています。

SINGLE-SEQUENCING-VALUE

 

第3世代シーケンシング-PacBio Sequel IIプラットフォーム

 

単一分子リアルタイム(SMRT)シーケンシングを提供するPacBio Sequel IIプラットフォームをご利用いただけます。ロングリードは、99.999%以上のコンセンサス精度で完全長転写産物のシーケンシングのために完全ゲノムを容易にアセンブルできます。他には、これまで解析不可能な領域の均一カバレッジ検出、単一分子の分解能向上、およびエピジェネティックな修飾の直接検出などの利点が挙げられます。

応用例:

  • WGS-de novoアセンブリ、バリアント検出、および構造変化 (SV) 検出
  • 全トランスクリプトームおよびゲノムアノテーションのためのRNAシーケンシング全長トランスクリプト取得
  • 複合集団解析のための全長16S配列取得、メタゲノム機能プロファイリング、およびショットガンメタゲノムアセンブリ

STANDARD-SEQUENCING-CONTINUOUS-READS

 

光学ゲノムマッピング -Bionano Saphyr®プラットフォーム

 

Bionano Saphyrプラットフォームは、ホモ接合型挿入/欠失、均衡型および不均衡型の転座、逆位、重複、ならびにコピー数変異を含む大規模な構造変異を、>95%の感度および2%未満の偽陽性率で解決します。

応用例:

  • 未診断の遺伝性疾患
  • 固形がん研究
  • 細胞株の安定性

bionano-saphyr

マイクロバイオーム解析

 

PacBio Sequel II と Illumina Novaseq 6000 を用いて糞便、組織、残存DNA、マイクロバイオーム解析を行うことが可能です。

応用例:

  • PacBio SequeIIプラットフォームを用いた全長16S rRNAシーケンシング
    • メタゲノミクスシーケンシング
  • メタトランスクリプトミクスシーケンシング
SHOTGUN-METAGENOMIC-SEQUENCING

 

ナノストリングサービス

 

ナノストリングサービスではnCounter®プラットフォームをご利用いただけます。

  • 最大800のRNA、DNAまたはタンパク質ターゲットのアレイベースのマルチプレックス解析
  • FFPE、組織、ライセート、および体液サンプルを含む柔軟なサンプルタイプ
  • 利用可能なパネル:
  • PanCancer IO 360 Panel
  • PanCancer Immune Profiling Panel
  • PanCancer Pathways Panel
  • PanCancer Progression Panel
  • 他の利用可能なパネルは こちらからご確認ください

応用例:

  • 遺伝子発現解析
  • 固形がんプロファイリング
  • がん免疫プロファイリング
  • 融合遺伝子解析
  • シングルセル遺伝子発現解析
  • miRNA発現解析
  • コピー数多型解析
  • lncRNA発現解析
  • ChIP-String発現解析 

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